wes-variant-calling-pipeline
Estado del proyecto: DesconocidoReproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.
- Software o hardware objeto del proyecto
- Tipo de trabajo
- Repositorio público principal
- github.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline
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Progreso comunicado
Checklist completion: ≈50 %
WES Variant-Calling Pipeline — Roadmap — 5/10 listed items checked; items are equally weighted
· Fuente
Descripción y alcance
Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.
Admisión de colaboraciones
Política de colaboración desconocida
- Política de contribuciones asistidas por IA
- Sin especificar
Sistemas documentados para colaborar
Entorno de colaboración sin documentar
Código fuente, compilaciones y versiones
- Abrir repositorio · github.comgithub.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline