wes-variant-calling-pipeline

Состояние проекта: Неизвестно

Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.

Исследуемое ПО или оборудование
Unknown
Тип работы
Восстановление исходного кода
Основной публичный репозиторий
github.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline
0Звёзды на GitHub

Проекты отсортированы по последнему зафиксированному числу звёзд репозитория. Звёзды отражают интерес, а не готовность проекта. Отсутствующие значения остаются неизвестными.

Метаданные репозитория требуют обновления. Сохранённая запись доступна.

Заявленный прогресс

Checklist completion: ≈50 %

WES Variant-Calling Pipeline — Roadmap — 5/10 listed items checked; items are equally weighted

· Источник

О проекте и его задачах

Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.

Приём стороннего участия

Правила участия неизвестны

Правила использования ИИ
Не указаны

Системы участников по документации

Окружение участника не описано

Исходники, сборка и релизы