wes-variant-calling-pipeline

Стан проєкту: Невідомо

Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.

Досліджуване ПЗ або обладнання
Unknown
Тип роботи
Відновлення вихідного коду
Основний публічний репозиторій
github.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline
0Зірки на GitHub

Проєкти впорядковано за останньою зафіксованою кількістю зірок репозиторію. Зірки показують зацікавленість, а не поступ роботи. Відсутні значення залишаються невідомими.

Метадані репозиторію потребують оновлення. Збережений запис залишається доступним.

Заявлений прогрес

Checklist completion: ≈50%

WES Variant-Calling Pipeline — Roadmap — 5/10 listed items checked; items are equally weighted

· Джерело

Про проєкт і його завдання

Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.

Можливість долучитися

Правила участі невідомі

Правила використання ШІ
Не зазначено

Системи учасників за документацією

Середовище учасника не описано

Вихідний код, збирання та релізи