wes-variant-calling-pipeline
Stan projektu: NieznanyReproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.
- Badane oprogramowanie lub sprzęt
- Rodzaj prac
- Główne publiczne repozytorium
- github.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline
Projekty są sortowane według ostatniej zapisanej liczby gwiazdek repozytorium. Gwiazdki oznaczają zainteresowanie, a nie postęp prac. Brakujące wartości pozostają nieznane.
Metadane repozytorium wymagają odświeżenia. Zapisany wpis pozostaje dostępny.
Podany postęp
Checklist completion: ≈50%
WES Variant-Calling Pipeline — Roadmap — 5/10 listed items checked; items are equally weighted
· Źródło
Opis i zakres prac
Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.
Możliwość współpracy
Zasady współpracy nieznane
- Zasady korzystania z AI
- Nie określono
Systemy współtwórców według dokumentacji
Brak dokumentacji środowiska współtwórcy
Kod źródłowy, budowanie i wydania
- Otwórz repozytorium · github.comgithub.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline