wes-variant-calling-pipeline
Stato del progetto: SconosciutoReproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.
- Software o hardware oggetto del progetto
- Tipo di lavoro
- Repository pubblico principale
- github.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline
I progetti sono ordinati per l’ultimo numero di stelle rilevato nel repository. Le stelle indicano interesse, non avanzamento. I valori mancanti restano sconosciuti.
I metadati del repository devono essere aggiornati. La scheda memorizzata resta disponibile.
Avanzamento dichiarato
Checklist completion: ≈50%
WES Variant-Calling Pipeline — Roadmap — 5/10 listed items checked; items are equally weighted
· Fonte
Descrizione e ambito
Reproducible Nextflow and Docker reimplementation of a whole-exome sequencing variant-calling pipeline (FastQC, FASTP, BWA, SAMtools, ANNOVAR), based on my MS thesis analysis.
Disponibilità ad accettare contributi
Regole sui contributi sconosciute
- Regole sui contributi assistiti dall'IA
- Non specificato
Sistemi documentati per contribuire
Ambiente di contribuzione non documentato
Fonti, compilazione e release
- Apri il repository · github.comgithub.com/mehwar-1/wes-variant-calling-pipeline