vep-rs
Projektstatus: UnbekanntA fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
- Untersuchte Software oder Hardware
- Arbeitsansatz
- Öffentliches Hauptrepository
- github.com/natera-open-source/vep-rs
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Über das Projekt und seinen Umfang
A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
Möglichkeiten zur Mitarbeit
Regeln zur Mitarbeit unbekannt
- Regeln für KI-unterstützte Beiträge
- Nicht angegeben
Dokumentierte Systeme für Mitwirkende
Arbeitsumgebung nicht dokumentiert
Gemeldeter Fortschritt
Kein Fortschritt gemeldet
Quellen, Builds und Veröffentlichungen
- Repository öffnen · github.comgithub.com/natera-open-source/vep-rs