vep-rs

État du projet: Inconnu

A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.

Logiciel ou matériel étudié
Unknown
Type de travail
Reconstruction du code source
Dépôt public principal
github.com/natera-open-source/vep-rs
36Étoiles sur GitHub

Les projets sont classés selon le dernier nombre d’étoiles relevé sur leur dépôt. Les étoiles reflètent l’intérêt, pas l’avancement. Les valeurs manquantes restent inconnues.

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Présentation et périmètre

A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.

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Règles sur les contributions assistées par IA
Non précisé

Systèmes documentés pour contribuer

Configuration pour contribuer non documentée

Avancement communiqué

Avancement non communiqué

Code source, compilations et versions