vep-rs

Стан проєкту: Невідомо

A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.

Досліджуване ПЗ або обладнання
Unknown
Тип роботи
Відновлення вихідного коду
Основний публічний репозиторій
github.com/natera-open-source/vep-rs
36Зірки на GitHub

Проєкти впорядковано за останньою зафіксованою кількістю зірок репозиторію. Зірки показують зацікавленість, а не поступ роботи. Відсутні значення залишаються невідомими.

Метадані репозиторію потребують оновлення. Збережений запис залишається доступним.

Про проєкт і його завдання

A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.

Можливість долучитися

Правила участі невідомі

Правила використання ШІ
Не зазначено

Системи учасників за документацією

Середовище учасника не описано

Заявлений прогрес

Прогрес не опубліковано

Вихідний код, збирання та релізи