vep-rs
Estado del proyecto: DesconocidoA fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
- Software o hardware objeto del proyecto
- Tipo de trabajo
- Repositorio público principal
- github.com/natera-open-source/vep-rs
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Descripción y alcance
A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
Admisión de colaboraciones
Política de colaboración desconocida
- Política de contribuciones asistidas por IA
- Sin especificar
Sistemas documentados para colaborar
Entorno de colaboración sin documentar
Progreso comunicado
No se ha comunicado el progreso
Código fuente, compilaciones y versiones
- Abrir repositorio · github.comgithub.com/natera-open-source/vep-rs