vep-rs
Status do projeto: DesconhecidoA fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
- Software ou hardware estudado
- Tipo de trabalho
- Repositório público principal
- github.com/natera-open-source/vep-rs
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Descrição e escopo
A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
Aceitação de contribuições
Política de contribuição desconhecida
- Política de contribuições com auxílio de IA
- Não informada
Sistemas documentados para contribuir
Ambiente de contribuição não documentado
Progresso informado
Progresso não informado
Código-fonte, compilações e versões
- Abrir repositório · github.comgithub.com/natera-open-source/vep-rs