vep-rs
Stato del progetto: SconosciutoA fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
- Software o hardware oggetto del progetto
- Tipo di lavoro
- Repository pubblico principale
- github.com/natera-open-source/vep-rs
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Descrizione e ambito
A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
Disponibilità ad accettare contributi
Regole sui contributi sconosciute
- Regole sui contributi assistiti dall'IA
- Non specificato
Sistemi documentati per contribuire
Ambiente di contribuzione non documentato
Avanzamento dichiarato
Avanzamento non dichiarato
Fonti, compilazione e release
- Apri il repository · github.comgithub.com/natera-open-source/vep-rs