vep-rs

Stan projektu: Nieznany

A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.

Badane oprogramowanie lub sprzęt
Unknown
Rodzaj prac
Odtwarzanie kodu źródłowego
Główne publiczne repozytorium
github.com/natera-open-source/vep-rs
36Gwiazdki w GitHub

Projekty są sortowane według ostatniej zapisanej liczby gwiazdek repozytorium. Gwiazdki oznaczają zainteresowanie, a nie postęp prac. Brakujące wartości pozostają nieznane.

Metadane repozytorium wymagają odświeżenia. Zapisany wpis pozostaje dostępny.

Opis i zakres prac

A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.

Możliwość współpracy

Zasady współpracy nieznane

Zasady korzystania z AI
Nie określono

Systemy współtwórców według dokumentacji

Brak dokumentacji środowiska współtwórcy

Podany postęp

Nie podano postępu

Kod źródłowy, budowanie i wydania