vep-rs
プロジェクトの状況: 不明A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
- 対象のソフトウェア・ハードウェア
- 取り組みの種類
- メインの公開リポジトリ
- github.com/natera-open-source/vep-rs
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概要と対象範囲
A fast, memory-efficient variant effect predictor written in Rust: a from-scratch reimplementation of the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP) that takes the same inputs and flags, emits VEP's consequence vocabulary in VEP's output formats, and annotates population-scale callsets two orders of magnitude faster than the Perl implementation.
協力の受け入れ状況
受け入れ方針は不明
- AIを利用した貢献の方針
- 明記なし
参加環境として資料に記載されているOS
参加環境の記録がないプロジェクト
報告されている進捗
進捗の報告なし
ソース・ビルド・リリース
- リポジトリを開く · github.comgithub.com/natera-open-source/vep-rs